Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc93Q7TQK5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms