Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Trappc6aQ78XR0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Trappc6aQ78XR0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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