Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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