Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.3 ms