Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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