Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nop58Q6DFW4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nop58Q6DFW4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nop58Q6DFW4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms