Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms