Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tbr1Q64336 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tbr1Q64336 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms