Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms