Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ly6eQ64253 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms