Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms