Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kdm5dQ62240 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Kdm5dQ62240 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.9 ms