Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Phox2aQ62066 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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