Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ecm1Q61508 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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