Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms