Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms