Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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RelnQ60841 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RelnQ60841 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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