Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms