Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Csnk2a1Q60737 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms