Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms