Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm5935Q497S0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5935Q497S0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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