Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrrc43Q3V0L5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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