Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms