Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms