Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Acsf3Q3URE1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms