Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms