Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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D13Ertd608eQ3UPR8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D13Ertd608eQ3UPR8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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D13Ertd608eQ3UPR8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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