Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms