Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms