Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc33Q3ULW6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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