Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U6N9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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