Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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