Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms