Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Jmjd8Q3TA59 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Jmjd8Q3TA59 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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