Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms