Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms