Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cers3Q1A3B0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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