Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd12Q0VE29 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms