Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab42Q0PD08 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms