Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms