Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms