Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms