Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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