Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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