Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms