Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top2aQ01320 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms