Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms