Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mesp1P97309 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms