Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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