Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cbx1P83917 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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